Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lrrc8eQ66JT1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms