Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf1Q64213 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms