Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hoxa13Q62424 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hoxa13Q62424 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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