Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cd180Q62192 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms