Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Smarcd1Q61466 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms