Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cd53Q61451 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cd53Q61451 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms