Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tfap2bQ61313 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms