Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Usp17laQ61068 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms