Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sim1Q61045 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sim1Q61045 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms