Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbbp7Q60973 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbbp7Q60973 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms