Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rbbp4Q60972 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms