Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Samhd1Q60710 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samhd1Q60710 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms