Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms