Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ClpbQ60649 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ClpbQ60649 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms