Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CttnQ60598 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CttnQ60598 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CttnQ60598 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CttnQ60598 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CttnQ60598 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms