Protein–RNA interactions for Protein: Q5XJY5

Arcn1, Coatomer subunit delta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Arcn1Q5XJY5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arcn1Q5XJY5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Arcn1Q5XJY5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Arcn1Q5XJY5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Arcn1Q5XJY5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Arcn1Q5XJY5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Arcn1Q5XJY5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Arcn1Q5XJY5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Arcn1Q5XJY5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Arcn1Q5XJY5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Arcn1Q5XJY5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Arcn1Q5XJY5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms