Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Atp13a3Q5XF89 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Atp13a3Q5XF89 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms