Protein–RNA interactions for Protein: Q5U458

Dnajc11, DnaJ homolog subfamily C member 11, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc11Q5U458 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Dnajc11Q5U458 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms