Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Brip1Q5SXJ3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Brip1Q5SXJ3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms