Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWK7

Rnf145, RING finger protein 145, mousemouse

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Length 663 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf145Q5SWK7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf145Q5SWK7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf145Q5SWK7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf145Q5SWK7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Rnf145Q5SWK7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf145Q5SWK7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms