Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc42Q5SV66 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc42Q5SV66 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms