Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ttf2Q5NC05 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ttf2Q5NC05 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms