Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG9

Znf488, Zinc finger protein 488, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf488Q5HZG9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Znf488Q5HZG9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Znf488Q5HZG9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Znf488Q5HZG9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Znf488Q5HZG9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Znf488Q5HZG9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms