Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ecm2Q5FW85 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ecm2Q5FW85 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms