Protein–RNA interactions for Protein: Q56A04

Eme2, Probable crossover junction endonuclease EME2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eme2Q56A04 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Eme2Q56A04 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eme2Q56A04 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms