Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Lin28bQ45KJ6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Lin28bQ45KJ6 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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