Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Pacs2Q3V3Q7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pacs2Q3V3Q7 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms