Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc185Q3V118 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc185Q3V118 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms