Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms