Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc27Q3V036 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccdc27Q3V036 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms