Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C87499Q3UX49 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C87499Q3UX49 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms