Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pfdn4Q3UWL8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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