Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Defb48Q3UW22 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Defb48Q3UW22 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms