Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm5460Q3UQ97 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms