Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
E130208F15RikQ3UPV3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms