Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef40Q3UPH7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef40Q3UPH7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms