Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usp30Q3UN04 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp30Q3UN04 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms