Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms