Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cog7Q3UM29 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms