Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trafd1Q3UDK1 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trafd1Q3UDK1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms