Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LbrQ3U9G9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms