Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q3U6N9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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