Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2S4

Otud5, OTU domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud5Q3U2S4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Otud5Q3U2S4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Otud5Q3U2S4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms