Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem35bQ3U0Y2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms