Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Trappc9Q3U0M1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc9Q3U0M1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms