Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccndbp1Q3TVC7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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