Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Fndc4Q3TR08 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Fndc4Q3TR08 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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