Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc102aQ3TMW1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms