Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gtf3c3Q3TMP1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms