Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trappc10Q3TLI0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trappc10Q3TLI0 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms